Jember – Universitas Islam KH. Achmad Muzakki Syah merupakan pengembangan dan Alih Status dari Institut Agama Islam Al-Qodiri Jember Tahun 2019, UNIKHAMS Jember resmi ditetapkan melalui Keputusan Menteri Agama RI Nomor : 1078 Tahun 2024.
Secara Formal Universitas Islam KH. Achmad Muzakki Syah merupakan lembaga pendidikan formal dibawah naungan Yayasan Pondok Pesantren Al-Qodiri 1 Jember yang terletak di Jl. Manggar 139 A kelurahan gebang kecamatan Patrang kabupaten Jember. tepatnya kurang lebih 2 km sebelah utara alun-alun kota Jember. Universitas Islam KH. Achmad Muzakki Syah berdiri pada tahun 2001, didirikan langsung oleh KH.Achmad Muzakki Syah yang merupakan pendiri dan pengasuh PP. Al-Qodiri Jember. Lembaga ini didirikan untuk menampung siswa dan siswi lembaga Formal dan Non Formal yang ada di PP. Al-Qodiri Jember, seperti Madrasah Aliyah Al-Qodiri dan Sekolah Menengah Kejuruan (SMK) Al-Qodiri. 
Secara embrional, Pendirian Sekolah Tinggi Agama Islam Al-Qodirialih bentuk menjadi IAI Al-Qodiri (dulu sebelum menjadi Universitas Islam KH. Achmad Muzakki Syah) adalah atas usulan dari Drs. Kamil, M.S.I. kepada Pengasuh dan Pendiri PP. Al-Qodiri Jember yaitu KH. Achmad Muzakki Syah, kalau bisa di Pondok Pesantren Al-Qodiri ada sebuah Perguran Tinggi dan bergabung dengan UIJ. Tetapi karena persyaratan-persyaratan yang diajukan terlalu berat, akhirnya Kyai ingin mendirikan sendiri sebuah Sekolah Tinggi berdasarkan YASPENDASRI dulu sebelum Ganti menjadi Yayasan Al-Qodiri (Yayasan pendidikan dakwah dan sosial Al-Qodiri) tahun 1988. kemudian tahun 2002 YASPENDASRI diganti menjadi Yayasan Al-Qodiri. tokoh yang diliebatkan pada waktu itu adalah Drs. H. Ach. Rifa’i Ikhsan, M.Pd.I., Drs. H. Samsul Hadi ,Tomi Hartono, S.Pd.I. dan lain-lain.
Pada awalnya ketua STAI Al-Qodiri Jember yang ditunjuk oleh kyai adalah Drs.Kamil,M.S.I,tetapi beliau menjabat sebagai dekan bahasa Inggris di UIJ, kemudian Drs.Kamil,M.S.I mengusulakan Drs.Ali Syaifullah,M.Pd.I sebagai Ketua STAI Al-Qodiri (2001-2006). Drs. Ainur Rofik, M.Ag. ketua STAI Al-Qodiri Jember (Periode 2007 – 2013), Periode 2014 hingga Sekarang dijabat oleh Dr. H. Asmad Hanisy, S.Pd.I, MM. Alih Bentuk dari IAI Al-Qodiri Jember menjadi Universitas Islam KH. Achmad Muzakki Syah.
Selama terbentuknya Fakultas Tarbiyah dan Keguruan, terdapat beberapa orang yang diberikan wewenang untuk memimpin Fakultas Tarbiyah dan Keguruan, diantaranya:
1. Dekan I : Ahmad Rosidi, M.Pd.I. (periode 2019-2024)
2. Dekan II : Dr. Muhamad Ansori, M.Pd.I. (Periode 2025 – 2028)
